在MPICH集群分布系统下复杂分子动力学的并行计算
李佳1; 刘信安2
2005-11-28
发表期刊计算机与应用化学
ISSN1001-4160
期号11页码:963-966
摘要在以MPICH技术构建的局域网集群系统下,利用分子动力学并行计算软件Protomol和三维分子模拟软件VMD构建大规模并行计算平台,完成若干复杂分子动力学典型实例的仿真运算。计算结果表明:采用并行计算能持续有效地利用现有计算机资源,同时大幅度提高计算效率,在现有并行集群系统下可以获得3倍以上的加速比,为实现复杂分子动力学的深入研究提供了可行方案。
关键词并行计算 MPICH 分子动力学 分子仿真
DOI10.16866/j.com.app.chem2005.11.003
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收录类别北大核心
语种中文
资助项目国家自然科学基金资助项目(200377054)
原始文献类型学术期刊
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.library.ouchn.edu.cn/handle/39V7QQFX/117642
专题国家开放大学重庆分部
作者单位1.重庆广播电视大学理工学院;
2.重庆大学化学化工学院
第一作者单位国家开放大学重庆分部
第一作者的第一单位国家开放大学重庆分部
推荐引用方式
GB/T 7714
李佳,刘信安. 在MPICH集群分布系统下复杂分子动力学的并行计算[J]. 计算机与应用化学,2005(11):963-966.
APA 李佳,&刘信安.(2005).在MPICH集群分布系统下复杂分子动力学的并行计算.计算机与应用化学(11),963-966.
MLA 李佳,et al."在MPICH集群分布系统下复杂分子动力学的并行计算".计算机与应用化学 .11(2005):963-966.
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