鸻形目鸟类线粒体基因组测序策略

doi:10.13859/j.cjz.201805012

	鸻形目鸟类线粒体基因组测序策略
	胡超超 1; 张怡 1; 张晨岭 2; 吴云豪 1; 陈婉 3; 李可欣 1; 常青 1
	2018-10-20
发表期刊	动物学杂志
ISSN	0250-3263
卷号	53 期号:05 页码:769-780
摘要	鸻形目(Charadriiformes),全世界约有384个物种,分属于19科94属,种类繁多、分布广泛,是研究迁徙和觅食行为的良好材料。近年来,线粒体基因组的研究快速发展,由于样品难以收集,缺乏系统的测序策略,鸻形目鸟类线粒体基因组的研究相对滞后。引物设计对聚合酶链式反应(PCR)至关重要,一个成功的PCR实验依赖于高质量的特异性引物,本研究拟设计一套用于鸻形目鸟类线粒体基因组扩增的通用引物。对GenBank中现有的鸻形目物种线粒体基因组进行多重比对,发现若干个保守性区域,本研究在该区域设计13对扩增鸻形目鸟类线粒体基因组的通用引物,扩增的目的片段长度均在1.5 kb左右。我们选取4个物种,即灰头麦鸡(Vanellus cinereus)、丘鹬(Scolopax rusticola)、白腰草鹬(Tringaochropus)和针尾沙锥(Gallinagostenura),进行PCR扩增验证,设计的引物在4个物种中均能顺利扩增、测序,该引物在鸻形目鸟类线粒体基因组扩增中的具有普遍适用性。本研究设计的13对通用引物在扩增鸻形目物种线粒体全基因组中具有较强的应用价值,将为鸻形目的系统发育关系、种群遗传学和生物地理学研究提供珍贵的资源。
关键词	鸻形目线粒体基因组聚合酶链式反应通用引物
DOI	10.13859/j.cjz.201805012
URL	查看原文
收录类别	北大核心 ; CSCD
语种	中文
资助项目	江苏省高校自然科学研究项目(No.16KJB180003和No.16KJB180012);江苏开放大学(江苏城市职业学院)“十二五”课题项目(No.15SEW-Y-018)
原始文献类型	学术期刊
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.library.ouchn.edu.cn/handle/39V7QQFX/138532
专题	国家开放大学江苏分部
通讯作者	常青
作者单位	1.南京师范大学生命科学学院; 2.江苏第二师范大学生化系; 3.江苏开放大学环境与生态学院
推荐引用方式 GB/T 7714	胡超超,张怡,张晨岭,等. 鸻形目鸟类线粒体基因组测序策略[J]. 动物学杂志,2018,53(05):769-780.
APA	胡超超.,张怡.,张晨岭.,吴云豪.,陈婉.,...&常青.(2018).鸻形目鸟类线粒体基因组测序策略.动物学杂志,53(05),769-780.
MLA	胡超超,et al."鸻形目鸟类线粒体基因组测序策略".动物学杂志 53.05(2018):769-780.