从江香猪发情期卵巢网格蛋白介导的内吞作用相关基因表达研究

	从江香猪发情期卵巢网格蛋白介导的内吞作用相关基因表达研究
	唐靓婷 1,2; 黄世会 1; 王嘉福 1; 冉雪琴 1; 李升 1; 牛熙 1
	2021-09-02
发表期刊	农业生物技术学报
ISSN	1674-7968
卷号	29 期号:09 页码:1741-1751
摘要	在卵巢卵泡发育过程中,卵母细胞与周围颗粒细胞之间形成缝隙连接通道,介导胞间通讯和物质转运,缝隙连接内在化可导致缝隙连接降解,是由网格蛋白介导的内吞过程(clathrin-mediated endocytosis, CME)。为了揭示CME对从江香猪(Sus scrofa)卵巢功能的调节作用,本研究以未发情期为对照,利用转录组测序技术,通过Limma、DESeq2和r MATS等软件以及逆转录PCR等技术,分析从江香猪发情期卵巢CME相关基因的表达和转录本发生的可变剪接。从江香猪卵巢中检测到8个CME基因表达,包括DAB衔接蛋白2 (DAB adaptor protein 2, DAB2),衔接蛋白复合体2亚基μ1 (adaptor related protein complex 2 subunitμ1, AP2M1),网格蛋白轻链(clathrin light chain, CLT) A (CLTA)和B (CLTB),动力蛋白1 (dynamin-1, DNM1),肌球蛋白Ⅵ(myosinⅥ, MYO6),动力蛋白2 (dynamin-2, DNM2)和网格蛋白重链(clathrin heavy chain, CLTC),其中差异表达的基因有DAB2、AP2M1和CLTB;除了CLTB外,其余7个基因在发情和未发情卵巢之间发生差异的可变剪接,这些可变剪接产生的7个转录本是目前Ensembl数据库暂未收录的新转录本。说明可变剪接是从江香猪发情过程中卵巢功能重要的调控方式,以CME过程中产生新的转录本和蛋白的方式组建蛋白互作网络。结果表明,通过转录和转录后水平调控CME相关基因的表达和转录本的剪接,来影响缝隙连接的内在化,从而调节从江香猪卵巢的功能。本研究有助于提高对猪转录后调控过程的认识,对从转录组水平解析猪卵巢功能的分子调节机制具有重要意义。
关键词	从江香猪网格蛋白介导的内吞作用(CME) 缝隙连接(GJ) 可变剪接卵巢
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收录类别	北大核心 ; CSCD
语种	中文
资助项目	国家自然科学基金(31960641;31672390);贵州省“百”层次创新型人才培养项目(黔科合人才(2016)4012号);贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才[2019]5615);贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2017]2585)
原始文献类型	学术期刊
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.library.ouchn.edu.cn/handle/39V7QQFX/149862
专题	国家开放大学贵州分部
通讯作者	王嘉福; 冉雪琴
作者单位	1.贵州大学农业生物工程研究院/动物科学学院; 2.贵州开放大学
第一作者单位	国家开放大学贵州分部
推荐引用方式 GB/T 7714	唐靓婷,黄世会,王嘉福,等. 从江香猪发情期卵巢网格蛋白介导的内吞作用相关基因表达研究[J]. 农业生物技术学报,2021,29(09):1741-1751.
APA	唐靓婷,黄世会,王嘉福,冉雪琴,李升,&牛熙.(2021).从江香猪发情期卵巢网格蛋白介导的内吞作用相关基因表达研究.农业生物技术学报,29(09),1741-1751.
MLA	唐靓婷,et al."从江香猪发情期卵巢网格蛋白介导的内吞作用相关基因表达研究".农业生物技术学报 29.09(2021):1741-1751.