小豆幼苗响应短日照诱导的转录组分析

	小豆幼苗响应短日照诱导的转录组分析
	董伟欣 1,2; 张磊 1; 李东晓 1; 张月辰 1
	2023-04-03
发表期刊	分子植物育种
ISSN	1672-416X
摘要	为明确短日照诱导对小豆开花的基因表达和代谢特征的影响。本研究以晚熟品种‘唐山红小豆’材料，利用RNA-Seq技术对短日照诱导后的小豆叶片进行转录组测序研究。结果表明：两个样本测序后共得到13.52 Gb Clean bases 数据且Q30碱基的平均值为94.09%，说明测序数据准确可靠；10 h10 d vs CK10 d(短日处理10 d与自然光照10 d相比较)比较组共获得2 528个差异表达基因，其中1 222个基因上调表达，1 306个基因下调表达；对获得的差异基因进行功能注释及富集分析，发现小豆的多种生物学功能受到短日照诱导的影响，GO富集到64个功能分类，对差异性显著的top30进行分析，发现向光性、光系统Ⅱ、昼夜节律3个功能类别与光照密切相关，其中昼夜节律功能的差异性最显著，此功能中共包含42个基因，其中有28个基因上调表达，14个基因下调表达；KEGG富集到5大类和18个小类代谢通路，对差异性明显的前20条代谢通路进行深入分析，发现植物激素信号转导代谢和昼夜节律两条通路的富集程度最高，说明这两条通路在小豆响应短日照诱导过程中发挥了重要作用，但植物激素信号转导代谢通路中的差异基因数目最多，为52个；从植物激素信号转导代谢通路图结果中发现，生长素代谢途径中有22个基因发生差异性变化。说明经过短日照诱导后小豆主要通过调控植株体内的激素变化来调控自身的生长发育，其中，受生长素(IAA)代谢途径的影响较大。
关键词	小豆短日照诱导转录组基因表达与代谢特征
收录类别	北大核心
语种	中文
资助项目	河北省自然科学基金项目(C2021204045);“财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系-食用豆(CARS-08-G-22)资助
原始文献类型	学术期刊
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.library.ouchn.edu.cn/handle/39V7QQFX/154019
专题	国家开放大学河北分部
通讯作者	李东晓; 张月辰
作者单位	1.河北农业大学农学院华北作物改良与调控国家重点实验室 2.河北开放大学
第一作者单位	国家开放大学河北分部
推荐引用方式 GB/T 7714	董伟欣,张磊,李东晓,等. 小豆幼苗响应短日照诱导的转录组分析[J]. 分子植物育种,2023.
APA	董伟欣,张磊,李东晓,&张月辰.(2023).小豆幼苗响应短日照诱导的转录组分析.分子植物育种.
MLA	董伟欣,et al."小豆幼苗响应短日照诱导的转录组分析".分子植物育种 (2023).