基于高通量测序技术分析汉中地区泡菜水细菌多样性
陈佩1; 刘莹1; 翟彩宁2; 党辉3
2021-12-25
发表期刊中国酿造
卷号40期号:12页码:93-97
摘要该研究采用Illumina Mi Seq高通量测序技术对陕西省汉中地区泡菜水中的细菌构成进行解析,并采用生物信息学方法对其多样性进行分析,同时结合多元统计学等手段探讨汉中泡菜水中微生物结构的差异。结果表明,泡菜水样品中的细菌菌群主要隶属于24个门的553属,优势细菌门为硬壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),其平均相对含量分别为89.12%和7.89%;优势细菌属为片球菌属(Pediococcus)、乳杆菌属(Lactobacillus)、假单胞菌属(Pseudomonas)和明串珠菌属(Leuconostoc),其平均相对含量分别为52.06%、31.40%、4.89%和1.83%。汉中地区的泡菜水样品可以划分为两个聚类,隶属于不同聚类泡菜水样品的α多样性指数无显著性差异(P>0.05),但细菌菌群结构存在较大差异(P<0.05),且片球菌属和乳杆菌属的相对含量存在显著性差异(P<0.05)。同时,不同聚类的泡菜水中均存在一些低丰度物种,且均为一些较为独特的细菌类群。
关键词泡菜水 细菌多样性 高通量测序 多元统计学
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收录类别北大核心
语种中文
资助项目陕西省第三批“青年杰出人才支持计划”(陕教工[2019]95号);陕西省科学技术研究发展计划项目(2017NY-182);陕西师范大学中央高校基本科研项目(GK201703069);陕西开放大学2020年度科研一般课题(20DB06)
原始文献类型学术期刊
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.library.ouchn.edu.cn/handle/39V7QQFX/151661
专题国家开放大学陕西分部
通讯作者党辉
作者单位1.陕西开放大学中瑞旅游与酒店管理学院;
2.陕西开放大学信息与智能技术学院;
3.陕西师范大学食品工程与营养科学学院
第一作者单位国家开放大学陕西分部
第一作者的第一单位国家开放大学陕西分部
推荐引用方式
GB/T 7714
陈佩,刘莹,翟彩宁,等. 基于高通量测序技术分析汉中地区泡菜水细菌多样性[J]. 中国酿造,2021,40(12):93-97.
APA 陈佩,刘莹,翟彩宁,&党辉.(2021).基于高通量测序技术分析汉中地区泡菜水细菌多样性.中国酿造,40(12),93-97.
MLA 陈佩,et al."基于高通量测序技术分析汉中地区泡菜水细菌多样性".中国酿造 40.12(2021):93-97.
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