吉林人参Dof基因家族的鉴定及表达模式分析

doi:10.19540/j.cnki.cjcmm.20211025.103

	吉林人参Dof基因家族的鉴定及表达模式分析
其他题名	Transcriptome-wide identification and expression pattern analysis for Dof gene family in Panax ginseng from Jilin
	王康宇 3; 郭彦秀 3; 马翀 3; 赵明珠 3; 李凤华 1,2; 张美萍 3; 王义 3
	2022
发表期刊	中国中药杂志
ISSN	1001-5302
卷号	47 期号:1 页码:62-71
摘要	Dof(DNA binding with one finger)转录因子是植物中特有的一类转录因子,在植物种子发育、组织分化和代谢调控方面起着非常重要的调控作用.为了研究Dof基因家族在人参中的数量和功能,该文以人参转录组数据库为基础,利用生物信息学手段,对人参Dof基因家族成员进行鉴定及其结构、进化、功能分化、表达模式及互作关系等进行了系统分析;同时,将人参Dof基因与已知人参皂苷合成关键酶基因进行关联分析,最终筛选到参与调控人参皂苷生物合成的候选PgDof基因.结果表明,吉林人参Dof基因家族含有57条基因;PgDof基因均具有Zf-Dof保守基序,在进化上比较保守且分成5个组群;表达模式分析结果确定了PgDof基因家族成员在不同组织部位、不同年生和不同农家品种之间存在不同程度的表达差异,同时通过"基因-皂苷含量""基因-基因"连锁分析,获得了PgDof14-1基因是参与调控人参皂苷生物合成的重要候选基因,并建立了该基因的人参发状根遗传转化体系,获得了阳性发状根无性系.该研究为人参中Dof基因家族的研究奠定了理论基础.
关键词	人参 Dof基因家族功能基因基因表达
DOI	10.19540/j.cnki.cjcmm.20211025.103
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收录类别	北大核心 ; CSCD
语种	中文
资助项目	国家重点研发计划项目(2013AA102604-3);; 吉林省科技厅国际合作项目(20200801063GH);; 吉林省教育厅项目(JJKH20200318KJ,JJKH20200320KJ)
原始文献类型	Periodical
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.library.ouchn.edu.cn/handle/39V7QQFX/25253
专题	国家开放大学黑龙江分部
作者单位	1.吉林农业大学生命科学学院,吉林长春130118; 2.吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心,吉林长春130118; 3.黑龙江广播电视大学教学部,黑龙江哈尔滨150080
第一作者单位	国家开放大学黑龙江分部
第一作者的第一单位	国家开放大学黑龙江分部
推荐引用方式 GB/T 7714	王康宇,郭彦秀,马翀,等. 吉林人参Dof基因家族的鉴定及表达模式分析[J]. 中国中药杂志,2022,47(1):62-71.
APA	王康宇.,郭彦秀.,马翀.,赵明珠.,李凤华.,...&王义.(2022).吉林人参Dof基因家族的鉴定及表达模式分析.中国中药杂志,47(1),62-71.
MLA	王康宇,et al."吉林人参Dof基因家族的鉴定及表达模式分析".中国中药杂志 47.1(2022):62-71.