基于COⅠ序列研究南海芋螺遗传多样性 | |
陈琴1; 彭超2; 赵峰1; 李军1; 高炳淼3 | |
2020-03-17 | |
发表期刊 | 基因组学与应用生物学
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ISSN | 1674-568X |
卷号 | 39期号:09页码:3955-3960 |
摘要 | 采用PCR扩增产物直接测序法获得南海3种芋螺的线粒体COⅠ基因序列,比较分析了其碱基组成、变异位点、遗传距离和系统进化树。研究结果表明,3种芋螺COⅠ部分序列为687 bp,碱基A、T、C、G平均为38.2%、23.0%、22.5%、16.3%,A+T值为62.42%,具有明显的碱基组成偏向性;具有种间变异位点数140个,碱基发生转换96次和颠换26次,转换与颠换的比值为3.69;采用的邻位相连法(neighbor-joining, NJ)和最大似然法(maximum likelihood, ML)构建的系统发育树均将10种芋螺主要分为2大支系,GenBank中选取7种芋螺聚类为第一大支,3种南海芋螺聚类为第二大支。因此,南海芋螺种间的遗传多样性具有地域性和独特性。 |
关键词 | 芋螺(Cone snail) 线粒体DNA COⅠ基因 遗传多样性 系统进化树 |
DOI | 10.13417/j.gab.039.003955 |
URL | 查看原文 |
收录类别 | 北大核心 ; CSCD |
语种 | 中文 |
资助项目 | 海南省自然科学基金项目(No.317170)资助 |
原始文献类型 | 学术期刊 |
文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | http://ir.library.ouchn.edu.cn/handle/39V7QQFX/51373 |
专题 | 国家开放大学海南分部 |
通讯作者 | 高炳淼 |
作者单位 | 1.海南广播电视大学; 2.深圳华大海洋科技有限公司; 3.海南医学院药学院 |
第一作者单位 | 国家开放大学海南分部 |
第一作者的第一单位 | 国家开放大学海南分部 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 陈琴,彭超,赵峰,等. 基于COⅠ序列研究南海芋螺遗传多样性[J]. 基因组学与应用生物学,2020,39(09):3955-3960. |
APA | 陈琴,彭超,赵峰,李军,&高炳淼.(2020).基于COⅠ序列研究南海芋螺遗传多样性.基因组学与应用生物学,39(09),3955-3960. |
MLA | 陈琴,et al."基于COⅠ序列研究南海芋螺遗传多样性".基因组学与应用生物学 39.09(2020):3955-3960. |
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